在正常状态下，大肠内不同品种的细菌群之间存在着动态平衡；不至于危害人体，而且在帮助消化等方面有着重要的作用。如大肠某些细菌所含的酶类，可使部分植物纤维和糖类分解或发酵，产生乳酸、醋酸、二氧化碳和沼气等。有些细菌所含的酶类则使脂肪分解为脂肪酸、甘油(丙三醇)和胆碱，因而大肠细菌分解食物残渣能提供少量营养物质。结肠细菌分解物残渣和尿素等物质产生氨；产量可达每天200～300mmol，其大部分被结肠吸收，并随血液进人肝脏，是肝脏合成氨基酸所需氨的高效来源。部分细菌能分解蛋白质，产生氨基酸、肽类、胺类、少量硫化氢和特臭的吲哚等。肠细菌又能利用肠内某些简单物质，合成少量B族维生素、叶酸和维生素K等，而具有重要的营养价值。