每个疾病都有其特点，掌握了特点就不难区别。我们已经知道，肛周脓肿位置有高位或低位（或深浅）之分。患低位脓肿时，患者的痛苦主要集中在肛门部，以肛门局部的红、肿、热、痛为主。患高位脓肿时，患者往往表现为发热、肛内痛，明显影响大小便。但是在临床上常有不少肛周脓肿的患者上述特点不明显，因此要详加鉴别。如果在排大便时肛门剧痛，但肛周无红肿，十有八九是肛门裂；如果有肛痛、肛缘突出或从肛内脱出肿物，不发热，便血或不便血，一般是痔疮；如果肛痛而便下秽浊污血，大便性状改变，一般是癌症。其他肛肠病如肛门瘘、溃疡性结肠炎等，肛门基本无疼痛感。总之，在排除了肛门裂、痔疮（主要是外痔和嵌顿痔）和肛门癌症后，能造成肛门疼痛的疾病基本上就是肛周脓肿了。