肛裂日久，反复发作，炎症，分泌物刺激而形成哨兵痔，以及肛乳头瘤。而许多人的哨兵痔，呈皮赘，质柔软。而乳头瘤也常为有细长系带的瘤状物，其瘤体常脱出肛门外，且多数为孤立一个，偶有两个乳头瘤同时存在，其色灰白，无触痛，质韧，光滑。

而尖锐湿疣是性传播性疾病，有较明确的不洁性交史。这也是鉴别肛裂和尖锐湿疣的重要依据之一。尖锐湿疣，有干性、湿性两种，干性湿疣呈暗色，色深，软。湿性湿疣，多呈绒毛状，其色淡红，有分泌物，存在于粘膜部位者居多。其可以孤立的肉芽状存在，但成团簇状，质韧。因为湿疣是包含增殖体生长，所以其生长速度极快。严重者可呈菜花状，根部较细。多数生长在皮肤和粘膜的交际处，生长在肛门者多在齿线下，肛缘附近，排便无任何不适，没有疼痛，以及出血。