内窥镜检查在结、直肠疾病的诊断及治疗上有重要作用。它可以用于诊断的疾病包括：①便血原因待查；②排便异常，如慢性腹泻或长期进行性便秘；③x线钡剂灌肠检查结果阴性，但有明显的肠道症状，尤其怀疑有恶性病变的患者，或x线钡剂检查异常，但不能明确性质；④乙状结肠镜检查未发现病变或病变性质未明者；⑤腹部包块，尤其下腹部包块需明确诊断者；⑥不明原因的消瘦、贫血；⑦结肠切除术后，需要检查吻合口情况者；⑧需行结肠腔内手术、激光治疗者，如结肠息肉切除术等。