有不少肛瘘术后已痊愈的患者反映，肛门有时会出现一过性刺痛，患者很恐惧，认为是肛瘘复发了。其实这是创面瘢痕组织增生较重，使愈合后的创面硬一些，较硬的瘢痕组织影响局部血液循环，局部组织缺血而抽搐，出现一过性刺痛，亦即瘢痕痛，故不必害怕。随着瘢痕组织的逐渐软化吸收，这种一过性的刺痛会渐渐消失，只是这种疼痛持续的时间有长有短，原则上手术创面越大或瘢痕体质者越易出现这样的瘢痕痛且持续时间也越长。