目前临床上关于肛瘘的分类方法虽然很多，但均有其不完善之处，至今尚无公认的统一分类标准，这里推荐Parks分类法，因其简明实用，对制定临床治疗方案最具参考价值，现介绍如下：按瘘管与括约肌的关系，将肛瘘分为四类：

1) 括约肌间肛瘘（低位肛瘘），最为常见，约占70%，是肛管周围脓肿的后遗症。瘘管只穿过内括约肌，外口常只有一个，距肛缘较近，为3-5cm;

2) 经括约肌肛瘘（低位或高位肛瘘），约占25%，为坐骨直肠窝脓肿的后遗症。瘘管穿过内括约、外括约肌浅部和深部之间，外口常有数个，并有支管互相沟通，外口距肛缘较远，约5cm；

3) 括约肌上肛瘘（高位肛瘘），占5%。瘘管向上穿过肛提肌，然后向下至坐骨直肠窝而穿透皮肤。由于瘘管常累及肛管直肠环，故治疗较困难；

4) 括约肌外肛瘘（高位肛瘘），占1%，为骨盆直肠间隙脓肿合并坐骨直肠窝脓肿的后果。瘘管穿过肛提肌，直接与直肠相通。这种肛瘘常为克罗恩病、肠癌或外伤所致。