冷冻疗法是应用一196℃的液氮或一89℃的液态一氧碳通过特制探头接触内痔，通过快速冻结痔组织及随后解达到组织细胞坏死的目的。

由于人体组织中含有97％的水、蛋白质和脂肪，冷冻瓦以使得细胞内液迅速冻结，细胞膜破坏，因离子改变，蛋白垄性，然后产生液化，引起组织破坏，所以冷冻可以直接导致问组织细胞变性坏死。同时，冷冻还能作用于痔核内的血管丛使微小血管发生水肿、内膜增生，引起管腔狭窄，加上血小凝集等因素，造成血流停滞，血管栓塞，导致痔组织缺血性坏死，其后通过组织修复，纤维组织收缩，内痔萎缩而达到治疗目的。

冷冻疗法主要适用于I、Ⅱ期内痔或脱垂型混合痔、血栓型外痔或结缔组织型外痔，慎用于伴有肛周感染及严重高血压的病人。由于该疗法存在持续疼痛时间长、创面愈合缓慢、继发性大出血等较多缺点，因此目前已很少使用。